被告自行撤销违法行政行为后，原告可以选择撤销诉讼，也可以选择不撤销诉讼。原告不撤销诉讼的，人民法院将根据《行政诉讼法》第七十四条第二款：行政行为有下列情形之一，不需要撤销或者判决履行的，人民法院判决确认违法行为：(二)被告改变原违法行政行为，原告仍要求确认原违法行政行为，判决确认被告违法行政行为。 　　结合郑的经验，律师特别提醒大多数被征收人，与征收人签订补偿协议必须保留协议原件，即使条件不允许，也应尽可能保留证据，以防止协议变更，因为无法证明和严重损害自己的利益。